Імпортували з 1с через xml файл податкову накладну, відправили на реєстрацію, отримали відмову реєстрації, тож зробили засобами Сонати копію з тим самим номером та датою та повторно відправили на реєстрацію. Отримали до другої накладної квитанції про реєстрацію. В переліку податкових відображаються обидві податкові накладні - імпортована з 1с в стані не прийнята а її копія в стані прийнята. Далі неприйняту податкову видалили в кошик. Тепер в переліку податкових накладних відображається податкова накладна створена копіюванням в Сонаті в стані прийнята, а в кошику імпортована накладна також отримала стан прийнята, хоча саме на неї була отримана квитанція з відхиленням реєстрації. Таким чином важко орієнтуватися в накладних, зробіть так щоб стан реєстрації не змінювався при переміщенні накладної в кошик.

Стан не змінюється при переміщенні у Кошик - тільки при отриманні квитанцій чи витягів. Певно, ви щось переплутали.
Конкретніше можна буде сказати, побачивши усю цю ситуацію. Зателефонуйте до нашої тех.підтримки за одним з телефонів, будь ласка - http://sonata.biz.ua/help/support