покупець вимагає, щоб в ПН я вказував його код філії. цитата з його листа:

"Код нашого филиала - ХХХ. С 29 июля 2015 года в налоговый кодекс внесены изменения и код филиала является обязательным в налоговой накладной. Где его нужно поставить в Вашей программе я незнаю. Я знаю только где в Медке можно поставить код филиала."

де, в сонаті, я можу вказати код філії покупця ?

В даному полі вказуєтья код філіі ПРОДАВЦЯ, а в мене питання щодо коду філіі покупця

С 29 июля 2015 года в налоговый кодекс внесены изменения и код филиала является обязательным в налоговой накладной.

Так, у ст.201.1, пп."г" Кодексу вимога є, але можливості її виконати немає через те, що на офіційному бланку Податкової накладної не передбачено поле для номера філії покупця - http://zakon1.rada.gov.ua/laws/show/z1235-14, затверджена форма накладної - http://zakon1.rada.gov.ua/laws/file/text/32/f433240n314.doc
Поля філій передбачені у новій формі ПН, але вона поки на стадії проекту і не використовується - http://sfs.gov.ua/diyalnist-/regulyatorna-politika-/regulyatorna-politika/2015-rik/64042.html

Я знаю только где в Медке можно поставить код филиала.

Поставити його у Медку можна, але цей номер є тільки на екрані у Медку, він не вноситься до електронного документу самої ПН (оскільки, як я писав вище, немає куди вносити). Якщо ви передасте таку накладну контрагенту з іншою програмою, він цей номер не побачить.

Мой покупатель просит указывать код филиала, чтобы именно филиал, а не головное предприятие, мог получить по запросу свою нн. В медке в налоговых накладных возле ИНН есть возможность вписывать код филии, в саму налоговую он не идет, но нужен для того, чтоб налоговая попала по адресу. Возможно ли реализовать подобную функцию в Сонате?

Форма ПН взагалі не передбачає філії отримувача.
Якщо ви хочете відіслати накладну на філію, то оберіть "Відправити - Відправити на філію контрагента" та вкажіть номер філії.